Wszystkie odpady wwożone na teren Przedsiębiorstwa Gospodarki Odpadami “Eko-Mazury” Sp. z o.o. podlegają ścisłej ewidencji. Służą do tego dwa stanowiska samochodowych wag przejezdnych, wyposażone w elektroniczne wagi platformowe o zakresie pomiarowym 60 Mg oraz system identyfikacji pojazdów i ładunku. Podczas wjazdu transportu rejestrowana jest jego masa brutto oraz ustalany jest rodzaj wwożonych odpadów. Pracownik obsługujący wagę dokonuje weryfikacji zgodności kodu odpadu zadeklarowanego przez przewoźnika z przewożonym odpadem. Jeśli stwierdzona zostanie niezgodność, wówczas inspektor ma prawo dokonać jego przeklasyfikowania lub odmówić przyjęcia odpadu.
Ponadto odpady sprawdzane są pod względem ich radioaktywności. Do tego celu wykorzystywany jest stacjonarny monitor promieniowania, którego detektory umiejscowione są przed wjazdem na wagę. Zgodnie z zaleceniami Państwowej Agencji Atomistyki, wszystkie transporty odpadów, których radioaktywność przekracza 2-krotnie poziom naturalnego promieniowania tła, muszą być zatrzymane w celu wyjaśnienia źródła podwyższonej radioaktywności.
Masa netto przekazanych odpadów ustalana jest podczas przejazdu pustego pojazdu przez wagę wyjazdową. Jest ona wówczas rejestrowana w dokumencie wagowym oraz następuje aktualizacja Karty Przekazania Odpadu, którą kierowca podpisuje w imieniu przewoźnika. Na podstawie obydwu dokumentów oraz aktualnego cennika wystawiana jest faktura VAT w terminie uzgodnionym w umowie.